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Obiettivo primario del Dottorato (Convenzione tra le Università di Palermo, Catania e Messina) è la formazione di giovani ricercatori nei settori della Matematica Pura e Applicata e delle Scienze Computazionali e la creazione di figure professionali che possano trovare sbocco sia nel settore della ricerca universitaria che nel mondo dell'industria.    
Il programma formativo si articola su tre livelli:
- frequenza di corsi di lezione (principalmente nei primi due anni) sia di base che sulle tematiche di ricerca del dottorato;
- impegno in progetti di ricerca;
- stesura della tesi di dottorato sotto la supervisione dei docenti specializzati nelle aree di ricerca scelte dai dottorandi (il terzo anno).
Gli studenti parteciperanno a seminari specialistici, ed avranno la possibilità di effettuare soggiorni di studio presso altre università che hanno dato la loro disponibilità, o di effettuare stages presso imprese, enti pubblici o centri di ricerca.
Lo sbocco occupazionale principale del Dottorato è nel settore della ricerca, sia universitaria che aziendale.
In ambito universitario, i neo dottori parteciperanno a bandi per assegni di ricerca, sia in Italia che all'estero, per proseguire l'attività di ricerca avviata con il dottorato. La formazione avanzata acquisita durante il dottorato permetterà ai neo dottori di ambire a posti di lavoro presso aziende ad alta tecnologia, dove le loro competenze di matematica (soprattutto applicata) e di informatica potranno risultare molto richieste.
L'analisi della situazione occupazionale dei neo dottori che abbiano conseguito il dottorato nelle discipline matematiche e informatiche mostra che di fatto la maggior parte dei neo dottori trova sbocco immediato in istituzioni di ricerca, sia in Italia che all'estero.

Dal 2022 la sede amministrativa del consorzio fra l’Università di Palermo, quella di Messina e quella di Catania per il dottorato di ricerca in Matematica e Scienze computazionali ha sede presso l’Università degli Studi di Messina: https://matematica-e-scienze-computazionali.phd.unime.it/it. L’attuale ciclo di dottorato è il XXXIX.