Proteomica e Genomica
Responsabili e contatti:
Prof. Salvatore Feo (salvatore.feo@unipa.it, 09123897323)
Prof.ssa Patrizia Cancemi (patrizia,cancemi@unipa.it, 09123897443)
Elenco attrezzature - Tariffario
Il laboratorio di Proteomica e Genomica è dotato di strumentazioni all’avanguardia per l’analisi e il sequenziamento degli acidi nucleici (mutazioni, variazioni di copie, modificazioni di DNA e RNA, analisi di polimorfismi e microsatelliti, del microbioma, etc.) e per lo studio dei profili d’espressione genica (trascrittoma e esoma) e proteica. Il laboratorio è in grado di fornire i sottoelencati servizi a dottorandi, assegnisti, ricercatori di UNIPA e a soggetti esterni all’Università in attività di conto terzi.
Servizi erogati:
- Sequenziamento Sanger di DNA e analisi microsatelliti e genotyping, a partire dall’estrazione e purificazione del DNA da campioni biologici, colture cellulari, colture batteriche o frammenti da PCR;
- Sviluppo di oligonucleotidi specifici per analisi quantitative di espressione genica tramite PCR (qRT-PCR);
- Analisi del Trascrittoma e Mirnoma tramite microarrays su piattaforma Agilent;
- Analisi Trascrittoma, Microbioma, Esoma, etc. tramite NGS su piattaforma Illumina;
- Costruzione di mappe proteomiche tramire eletroforesi bidimensionale (2D-gel);
- Allestimento saggi ELISA, saggi di “gene reporter”, saggi colorimetrici o enzimatici su supporti multiwell.
Attrezzature presenti in laboratorio:
- Applied Biosystem Genetic Analyzer 3500 - 8 capillari - Analisi genetiche e sequenziamento Sanger di DNA;
- Applied Biosystem Quantstudio 6 Flex Quantitative Real-time PCR in multiplex fast;
- MiSeq Sequencing System, Illumina - Piattaforma next-generation sequencing (NGS) per RNAseq, DNAseq, Microbioma, etc.
- Hamilton Microlab StarLet – uno con 4 canali e gripper e uno 8 canali con cappa a flusso laminare - Stazione automatizzata di manipolazione liquidi per estrazione di DNA, RNA, e di pipettamento automatico multifunzionale in ambiente sterile;
- Ettan Dalt gelcaster; Ettan Ipgphor e Typhoon FLA 9500 laser scanner - Piattaforma elettroforetica 2D per analisi proteomiche dell’Amersham;
- SureScan Dx G5761AA e Forno di Ibridazione G2545A Agilent- Piattaforma per ibridazione e scansione microarray dell’Agilent;
- Bioanalyzer 2100 Agilent - Analizzatore in microfuidica di DNA e RNA, determinazione RIN (RNA Integrity Number)
- TECAN Spark 100 - Lettore di piastre multiwell per analisi in assorbanza, fluorescenza e luminescenza.
Attività didattica:
- svolgimento di training formativi sulla teoria e uso pratico a dottorandi e assegnisti UNIPA su sequenziamento del DNA e tecniche per il Quantitative Real-time PCR in multiplex
- supporto alle attività di ricerca di dottorandi, assegnisti, ricercatori di UNIPA.
Supporto alle attività di ricerca di:
- Supporto ai progetti di ricerca dell’Ateneo e alle convenzioni di ricerca stipulate tra ATeN Center con enti esterni
- Fondazione Ri.MED (https://www.fondazionerimed.eu)
- La Neoolife Innovative Biomedical Tissue (https://neoolife.com)
Campi di applicazione:
Genetico, Farmacologico, Biomedico, Nutraceutico, Agroalimentare, Biotecnologico.