La sede di Geografia raccoglie il patrimonio storico dell'Istituto di Geografia, un tempo della Regia Università, poi confluito nel 2001 nel Dipartimento di Beni Culturali denominato nel 2013 Dip. di Culture e Società.
Il “Villino Partanna” era la dépendance dell’omonimo Palazzo adiacente, dimora nobiliare del XVIII secolo danneggiato nel corso dell’ultima guerra ed in seguito demolito. L’edificio è stato rimodernato nel periodo liberty, di cui ha mantenuto la bussola con pensilina in ferro battuto e una splendida terrazza al secondo piano con vista su Piazza Marina. La pavimentazione della sala lettura al pian terreno e delle stanze ai piani superiori conserva i preziosi marmi originali; al secondo piano una sala di rappresentanza è arredata da una pregiata boiserie in noce realizzata dagli stabilimenti Ducrot e da un grande mappamondo del XIX secolo.
Oggetto principale delle rappresentazioni è la Sicilia, di cui la cartoteca conserva in folio quasi tutte le descrizioni IGM; la cartoteca storica vanta oltre ad atlanti inglesi, molti documenti in formato telato sull’Africa, relative alla conoscenza delle colonie dal XVI secolo ai primi decenni del ‘900.  La biblioteca è specializzata nel campo della geografia umana e della geografia economico-politica. Custodisce una raccolta di 13.000 monografie e 1.260 annate di periodici, completi dalle prime edizioni del 1800, di ambito geografico; è presente anche una cospicua raccolta di cartografia moderna IGM.
In sala di lettura è possibile consultare il catalogo cartaceo ed effettuare prestiti temporanei; la sala al primo piano con la cartoteca ha un accesso limitato.