La biblioteca di Villa Genuardi è sita dal 1993 nei locali concessi in uso dalla Regione Sicilia ed è ubicata nella parte alta della splendida Valle dei Templi. Possiede un patrimonio di oltre 10.000 volumi ed i fondi speciali degli archeologi Ettore Gabrici (1868-1962) ed Paolo Enrico Arias (1907-1998). I volumi sono disponibili a scaffale aperto e collocati secondo la classificazione Dewey.
Gli ambiti disciplinari interessati dalla biblioteca sono prevalentemente di carattere storico-archeologico, arte antica (pittura e scultura greca e romana), restauro, numismatica, topografia, epigrafia greca e latina, pubblicazioni relative alle attività di scavo, edizioni dei classici greci e latini.

La biblioteca del plesso didattico di Via Filippo Quartararo, possiede un patrimonio di circa 5.000 volumi, collocati a scaffale aperto secondo la classificazione Dewey. Gli ambiti disciplinari coperti sono prevalentemente di carattere economico-giuridico, di architettura e di scienze sociali.